PROYECTO

NOMBRE:Espaciador Transcrito Interno (ITS) como marcador molecular para la identificación de la Roya de la Soya
RESPONSABLE:Cristóbal Aldama Aguilera
INSTITUCIÓN/EMPRESA DONDE SE DESARROLLA:UASLP-SENASICA
MONTO:45,000.00
VIGENCIA:04/2015 - 12/2015
LÍNEA DE INVESTIGACIÓN:
DESCRIPCIÓN:En México la producción de soya enfrenta en la actualidad la amenaza de la roya, una enfermedad que puede disminuir la producción de la soya entre 80 y 100% por defoliación prematura. El objetivo de esta investigación fue generar nuevos oligonucleótidos para la detección de P. pachyrhizi diseñados a partir de la secuencia del ITS1-2 del gen ribosomal 5.8S. Se diseñaron dos pares de oligonucleótidos, Ppha1-2 y Ppha 3-4, con productos de amplificación esperados de 342 y 343 pb, respectivamente. El diseño se llevo a cabo a partir de la secuencia disponible en NCBI (EU523736.1) y mediante un software bioinformático (Primer3). Se obtuvieron 10 muestras de material vegetal infectado por Phakopsora pachyrhizi provenientes de cultivos de soya del municipio de Ébano, San Luis Potosí. Las muestras fueron sometidas a extracción con buffer SDS y a PCR con los oligonucleótidos generados en este trabajo, se utilizó DNA de P. pachyrhizi proporcionado por el SENASICA como control positivo de amplificación. Los productos de amplificación fueron recuperados del gel de agarosa por separado y purificados con Wizard® Purification Kit, para ser enviados a su secuenciación en el Laboratorio Nacional de Biotecnología Agrícola, Médica y Ambiental del IPICYT. Se lograron obtener productos de amplificación por PCR con los oligonucleótidos propuestos. Ambas secuencias obtenidas se alinearon en 98% con P. pachyrhizi de acuerdo a los datos del análisis de alineamiento de secuencias de la herramienta BLAST de NCBI.
PARTICIPANTES UASLP:
PARTICIPANTES EXTERNOS: